Nuo 1996 m. Nacionalinė visuomenės sveikatos priežiūros laboratorija gamina aukštos kokybės ir tarptautinius gamintojų standartus atitinkančias mikrobiologiniams tyrimams skirtas terpes. 2002 m. Kultūros medijų gamybos skyrius ir Kokybės kontrolės skyrius buvo sertifikuoti „Bureau Veritas Lithuania“ pagal standartą EN ISO 9001.
NVSPL sėkmingai dalyvavo neurotropinių virusų diagnostikos patikroje. Tai vienintelė Lietuvos laboratorija, kuri dalyvavo Erkinio encefalito viruso RNR nustatymo išorinėje kokybės patikroje.
NVSPL Klinikinių tyrimų skyriaus Serologinių tyrimų poskyrio darbuotojai sėkmingai dalyvavo ECDC organizuotoje SARS-CoV-2 serologinių tyrimų išorinėje kokybės kontrolės programoje. Kadangi SARS CoV-2 antikūnų tyrimai yra nauji laboratorinės diagnostikos praktikoje, labai svarbu įsivertinti, ar laboratorijos pasirinkti tyrimo metodai ir reagentai atitinka keliamus reikalavimus.
NVSPL sėkmingai dalyvavo Zikos viruso diagnostikos patikroje.